A categoria aparece na meio da década de 40 e ao que tudo indica os treinadores dos seniores acompanhavam e treinavam a equipa de formação, pelo menos até muito perto do final dos anos sessenta.
O escalão servia essencialmente para formar jovens jogadores que iriam depois fazendo parte das terceiras e segundas categorias até poderem jogar na equipa principal.
A partir de 1994 e até cerca de 2000? a Federação permitia a inscrição de jogadores (3?) nos jniores que fossem do 1.º ano de seniores.
Nos finais de 1959 ou inicio de 1960, sob orientação de Fernando Cabrita formou-se a primeira escola de futebol do Portimonense com o objectivo de formar os seus próprios jogadores em vez de ter que "pescar" nos clubes vizinhos os jogadores para os juniores e seniores.
Naquela altura não existiam Iniciados nem Juvenis, e era complicado encontrar espaços ou formar equipas com atletas mais jovens para se fazer treinos com onze jogadores de cada lado.
A denominação "Futebol de Salão", assenta simplesmente no facto, de na altura esta ser a modalidade que permitia opor num jogo de futebol equipas de cinco jogadores de cada lado.
Ao contrário do que o nome indica, os jovens atletas evoluiam no ringue ao ar livre que existia nas instalações do clube.
Uma vez que o Portimonense só tinha Juniores e Senioes, este projecto consistia em formar jovens jogadores até aos 15 anos para que pudessem, depois, já com alguma experiência evoluir no futebol de onze, primeiro nos juniores e mais tarde alinhar na equipa principal.

Juvenis
Apesar de supostamente só a partir de 1970/71 ter sido oficializado este escalão no Portimonense, já encontramos registos de alguns jogadores inscritos desde 1966/67

Iniciados
Os iniciados tieveram inicio a partir de 1973/1974
Infantis
Surgem em 1979/1980 os primeros registos de jogadores inscritos neste escalão

Pode ler-se no livro do Portimonense "1914/2003 - 89 Anos de História" de Armando Alves:
O primeiro êxito do futebol juvenil do Portimonense remonta a 50/51, com um triunfo por 2-1, diante do Farense, em Silves, a proporcionar uma saborosa conquista: o titulo distrital de juniores. Cerca de uma decada mais tarde os alvi-negros viriam a ter uma excelente equipa naquele escalão, orientada por Fernando Cabrita, que desenvolveu um interessante projecto de fomento das camadas jovens, debatendo-se, contudo, com a falta de condições.
Em 70/71 o clube passou a contar com uma formação de juvenis e os sucessos eram espaçados, com as dificuldades a aumentarem depois da subida do clube à I Divisão, em seniores: o arrelvamento do campo 'despejou' as camadas jovens do unico espaço (então) existente na cidade e só o entusiasmo de um grupo reduzido de 'carolas' permitiu que o clube mantivesse equipas na formação.
Dois titulos de juniores e outros dois de iniciados nao esconderam as imensas dificuldades vividas em toda a década de 80 e, num ano, o Portimonense nem sequer formou equipa de juniores. Noutros, a qualidade do trabalho desenvolvido deixou muito a desejar, pois os treinos e os jogos disputavam-se em campos emprestados (Alvor e Montes de Alvor), com as consequentes dificuldades de ordem logistica dai resultante, não raras vezes traduzidas em prestações competitivas longe do desejavel. Os apoios eram escassos e faltava de tudo um pouco.
Em 87/88 os juniores sagraram-se campeões do Algarve, ascendendo ao nacional da I Divisão, mas depressa voltariam aos regionais, como havia sucedido noutras ocasiões. Só a partir de meio da década de 90 o futebol juvenil viu um quadro de todo desfavorável alterar-se: Alberto Estevão, entretanto eleito presidente, definiu a formação como uma das prioridades e, sob o impulso de Luis Batalau e outros dirigentes, foi feito um esforço significativo no ambito das infra-estruturas, primeiro passo para uma melhoria qualitativa.
Os resultados de tal investimento nao tardaram: dois titulos distritais de juniores, quatro de juvenis e um de iniciados e uma presença regular nos campeonatos nacionais desses escalões assinalaram a o final da década de 90, havendo ainda a acrescentar a presença nas segundas fases em algumas temporadas. Tudo sob o comando de técnicos diplomados, com as condições imprescindiveis para o desenvolvimento de um trabalho capaz, incluindo apoio médico e equipamentos.

NOTAS:
Idades/Escalões:
11-12 Infantis
13-14 Iniciados
15-16 Juvenis
17-18 Juniores